* 1953年,安徽省工业试验所成立,隶属于当时的安徽省工业厅
* 1956年,调整成立安徽省科学研究所(筹),并于次年正式建立
* 1958年,调整成立安徽省科学院,后曾用名中国科学院安徽分院
* 1962年,中国科学院华东自动化元件与仪表研究所在合肥正式成立
* 1968年5月,合并部分单位组建成国防科委1123研究所
* 1970年1月,改建为中国人民解放军总后勤部第3609工厂
* 1973年8月,重组成立安徽无线电研究所
* 1979年10月8日,重新建制归属于中国科学院,正式成立并定名为中国科学院合肥智能机械研究所,简称智能所
* 1985年,智能所建成我国第一个计算机农业专家系统
* 1987年,智能所创办所属第一个高新技术企业
* 1988年,智能所正式迁入合肥市西郊董铺岛,即“科学岛”
* 1988年,智能所成立传感技术国家重点实验室及厚膜专业点
* 1991年,智能所建立国家863机器人传感技术网点实验室
* 2001年5月,智能所进入中国科学院知识创新试点工程
* 2004年6月,智能所知识创新方案得到中国科学院批准,并整体进入中国科学院合肥物质科学研究院体系
* 2020年5月,中科院合肥物质科学研究院下属原先进制造技术研究所、技术生物与农业工程研究所和应用技术研究所以及原智能机械研究所按新的学科方向组建成新的智能所。