杨先军|所长，全面负责研究所工作。分管研究所发展战略规划、重大项目、平台建设、财务与预算，联系学术委员会。

邓国庆|党委书记、副所长。主持研究所党委工作，分管党建、干部人事、人才引进、创新文化、宣传、职代会、工会、群团、资产、科技合作与知识产权体系。

宋全军|纪委书记、副所长。主持研究所纪委工作，分管纪检、审计、科研诚信与科技伦理、档案、科学传播，协管党务、发展战略规划、平台建设、重大项目。联系智能感知中心、运动健康中心。

黄河|副所长，分管基础研究、研究生教育、科教融合、国际合作，协管农业领域重大项目，联系智慧农业中心、离子束农业中心。

陈池来|副所长，分管战略高技术、质量管理、安全保密、后勤、基建，协管高技术领域重大项目。联系仿生智能中心、先进制造中心、无人系统中心。